Huh, jól bele kérdeztél... :)

A template fájl: gyakorlatilag ez a sablon html (lehet más is, de maradjunk ennél), amit a drupal feltölt adatokkal. Az adatbázisban lévő adatokat először előszedi, megcsócsálja, kirajzolja.

pl, node/1-es tartalom, egy sima oldal. Először a node/1 alapján megkeresi az 1-es idjű tartalmat, betölti. Ha vannak hozzá egyéb mezők, akkor azt is (képek, pl).

Ezután jön az, hogy olyan formára kell alakítani, ahogy meg kell jeleníteni. Ez a mezők sorrendjétől kezdve az elhagyja-e a labelt, formázásokig bármi lehet. Ha ez megvan, akkor meg kell jeleníteni. Erre való a theme() fv, és a themelés - sminkelés.

A theme vagy smink réteg már nem szabad, hogy alkalmazás logikai dolgokat csináljon (pl, hozzáférés a teljes body elemhez), ezeknek már meg kell lenniük, mire a megjelenítéshez érünk.

A smink réteg csak megjelenit. Függvényeken, vagy sablon fájlokon keresztül. Úgy kell elképzelni d7-ben hogy kapsz egy tömböt, minden megjelenítendő adattal, csinálsz vele valamit. Egészen apró dolgoktól kezdve - mezők, az egyre nagyobbakig, block, node, page, html. A rajzod jól szemlélteti ezt.

A fenti képből kiindulva: megkeresi a node-ot. A node mezőkból áll. A mezők megjelenítéséhez szükséges adat bennek lesz egy tömbben. A mezőt a field.tpl-en keresztül jeleníti meg. A fieldekből összeáll a node.tpl ($content változó már tartalmazza az összes sminkelt mezőt). Aztán jön az, hogy van-e hozzá megjegyzés. Ha van, akkor megjegyzés mezők -> megjegyzés (comment.tpl) ->megjegyzés wrapper (comment.wrapper).

Ez megy a page.tpl-be. Ide kellenek még régiók, amik blokkokból állnak: minden blokknál a fenti folyamat lejátszódik (block.tpl). A blokkok régióban region.tpl. Majd az egész page.tpl-t a html.tpl veszi körül.

A preprocess pedig abban segít, hogy az elkészült adatokat a megjelenítés előtt még át tudd alakítani: pl. page_preprocess: kell egy speciális css osztály, ami tartalmazza a tartalom típust. Ekkor a preprocess-ben a kapott tömböt kiegészíted: a body_classes tömbhöz hozzáfűzöd a saját osztályaidat.

Igazából azt kell felfogni: mindere van egy alapértelmezés - node.tpl.php. Ha te sajátot szeretnél a story tartalmadnak, akkor csinálhatsz egy node--story.tpl.php-t. Ekkor a story típusú tartalmak már ezzel fognak megjelenni. Ha a 17-es node-hoz szeretnél egy sablont (mert az az egy kicsit másképp kell megjelenjen), akkor a node--17.tpl.php-t hozd létre, és annál az egy tartalomnál ezen sablon fogja megjeleníteni a tartalmad.

http://drupal.org/node/171194 - Overview of theme files
http://drupal.org/node/1089656 - Template suggestions - érdemes végignézni. Akár tartalmanként eltérő sablonod lehet. De minden blokknak.

Nagyon jó könyvek vannak a témában, elsősorban angolul - magyarul csak Gusztáv könyvét tudom D6-hoz. Ha konkrétabb, gyorsabb segítség kell -> #drupal.hu csatorna az irc-n.